RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4F2P78329 520 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CYP4F3Q08477 520 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CLCA4Q14CN2 919 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EDRF1Q3B7T1 1238 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EPC2Q52LR7 807 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PALB2Q86YC2 1186 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PHC2Q8IXK0 858 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CDCA5Q96FF9 252 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 IFT22Q9H7X7 185 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 STK17AQ9UEE5 414 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 POLG2Q9UHN1 485 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CLRN2A0PK11 232 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PRR23AA6NEV1 266 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TRMUO75648 421 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 BCL10O95999 233 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ATF3P18847 181 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 C4BPBP20851 252 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CES1P23141 567 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 DLG4P78352 724 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KDSRQ06136 332 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MAML1Q92585 1016 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SGK3Q96BR1 496 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 KRT12Q99456 494 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HEPHQ9BQS7 1158 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ABCG8Q9H221 673 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CAB39LQ9H9S4 337 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 RAB21Q9UL25 225 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SLC5A1P13866 664 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SULT2A1Q06520 285 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PPP2R5EQ16537 467 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CCNJLQ8IV13 435 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MLKLQ8NB16 471 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM87AQ8NBN3 555 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 TAMM41Q96BW9 452 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINI1Q99574 410 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0J9YVX5 310 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 B8ZZF3 427 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SLC4A1P02730 911 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A1P19634 815 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA13P48723 471 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CDK7P50613 346 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GSTO1P78417 241 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A5Q14940 896 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 Q3ZCU0 254 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PGM2L1Q6PCE3 622 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DENND6AQ8IWF6 608 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NUP93Q8N1F7 819 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00469Q8N7U9 141 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf50Q9BV19 199 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 TIPINQ9BVW5 301 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 UVRAGQ9P2Y5 699 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MAP3K1Q13233 1512 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 NFIBO00712 420 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SIN3BO75182 1162 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 CCNKO75909 580 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 SNAP29O95721 258 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 ITGB3P05106 788 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRC-209ENST00000442510 MYL3P08590 195 aa5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms