RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436724.5

PTPRF-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 2,168 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-207ENST00000436724 PMM2O15305 246 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 TNFSF9P41273 254 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PRKCIP41743 596 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 TFDP1Q14186 410 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 GRIK4Q16099 956 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 USP37Q86T82 979 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 AKT3Q9Y243 479 aa22.86■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 TOM1L1O75674 476 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PTENP60484 403 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PSMD6Q15008 389 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 SETD4Q9NVD3 440 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 A0A087WZ62 844 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 MAGEB2O15479 319 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 TNNI1P19237 187 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FNBP1Q96RU3 617 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PI4K2AQ9BTU6 479 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FZD8Q9H461 694 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 KAT6AQ92794 2004 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FAM189A1O60320 539 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 FERP16591 822 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 RAB20Q9NX57 234 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 COL1A2P08123 1366 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 ABLIM1O14639 778 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 ASAP2O43150 1006 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 AOC2O75106 756 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRF-207ENST00000436724 ACKR2O00590 384 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 IGHA2P01877 340 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 GTF2H1P32780 548 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 GPC3P51654 580 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CLDN10P78369 228 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 BEX3Q00994 111 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 KAT2BQ92831 832 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 FAM170AA1A519 330 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CTAGE9A4FU28 777 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 ENC1O14682 589 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TBC1D8O95759 1140 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 RFX1P22670 979 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 PSMC4P43686 418 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 GABRQQ9UN88 632 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 MGAMO43451 1857 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TMOD1P28289 359 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TATDN2Q93075 761 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 MOCS3O95396 460 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 F2P00734 622 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CEP120Q8N960 986 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 HELQQ8TDG4 1101 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 NAGPAQ9UK23 515 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.248e-13■■■■□ 20.4
PTPRF-207ENST00000436724 PJA2O43164 708 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 PROZP22891 400 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 USP8P40818 1118 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 PHKA2P46019 1235 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 OSTNP61366 133 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 CAP1Q01518 475 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 ENPEPQ07075 957 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 MCL1Q07820 350 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 IRF5Q13568 498 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 ZACNQ401N2 412 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRF-207ENST00000436724 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.8■■□□□ 1.24
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