RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 CDC25AP30304 524 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 PRPHP41219 470 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 NHLH1Q02575 133 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 TUSC3Q13454 348 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 IER5LQ5T953 404 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB33Q86T24 672 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 GPR65Q8IYL9 337 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 DAW1Q8N136 415 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 TMX3Q96JJ7 454 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.18■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 GLUD1P00367 558 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 EFNA5P52803 228 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 USP41Q3LFD5 358 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 KCNK18Q7Z418 384 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 PRSS33Q8NF86 280 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 IFT74Q96LB3 600 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RAB34Q9BZG1 259 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 STK24Q9Y6E0 443 aa22.17■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ST18O60284 1047 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 KIF4AO95239 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 PAPLNO95428 1278 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 MAPK7Q13164 816 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 MTMR3Q13615 1198 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RTP2Q5QGT7 225 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 FNIP2Q9P278 1114 aa22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RFPL2O75678 378 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 THP07101 528 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 MYBP10242 640 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 KRT79Q5XKE5 535 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 HASPINQ8TF76 798 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 RUSC1Q9BVN2 902 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 DNM3Q9UQ16 869 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 KIF3AQ9Y496 699 aa22.15■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.14
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TGM5O43548 720 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TADA2AO75478 443 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 C1RP00736 705 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GJB2P29033 226 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 NPTX2P47972 431 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PEX3P56589 373 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 RINT1Q6NUQ1 792 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 LILRA6Q6PI73 481 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GDAQ9Y2T3 454 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 VWA8A3KMH1 1905 aa22.14■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 HIP1RO75146 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA31D3P0C874 917 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 HYIQ5T013 277 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 MCTP1Q6DN14 999 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PALB2Q86YC2 1186 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CEP120Q8N960 986 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PNMA5Q96PV4 448 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 DPP7Q9UHL4 492 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PIEZO1Q92508 2521 aa22.13■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 TRIP11Q15643 1979 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 K7ERI5 159 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
HLA-B-250ENST00000434333 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
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