RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 CASTOR2A6NHX0 329 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 ACKR2O00590 384 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 RFPL2O75678 378 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 TUSC3Q13454 348 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 PPP2R5AQ15172 486 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 ECM1Q16610 540 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 GPR65Q8IYL9 337 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 IFT74Q96LB3 600 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 POLD4Q9HCU8 107 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 LRWD1Q9UFC0 647 aa21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 TGM5O43548 720 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 RECQL4O94761 1208 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 CREMQ03060 361 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 HASPINQ8TF76 798 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 STAMQ92783 540 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 FNIP2Q9P278 1114 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.52■■□□□ 1.04
CCDC189-201ENST00000433909 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PTGESO14684 152 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 C1RP00736 705 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 EDN1P05305 212 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 THP07101 528 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 NUBP1P53384 320 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 TDGQ13569 410 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 RTP2Q5QGT7 225 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 KIFAP3Q92845 792 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 KIF2CQ99661 725 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 KCNK12Q9HB15 430 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PIDD1Q9HB75 910 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 FAM86C1Q9NVL1 165 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 CLUHO75153 1309 aa21.51■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 KIF4AO95239 1232 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 EFNA5P52803 228 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 RAB34Q9BZG1 259 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 GDAQ9Y2T3 454 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 STK24Q9Y6E0 443 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.5■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PLXNA3P51805 1871 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PTGDRQ13258 359 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PDIA5Q14554 519 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 LILRA6Q6PI73 481 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 CEP57Q86XR8 500 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 TTPALQ9BTX7 342 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 H0Y858 1186 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 NAB2Q15742 525 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 FLCNQ8NFG4 579 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 MYADMQ96S97 322 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.48■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 USP34Q70CQ2 3546 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PSMD5Q16401 504 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PIK3R5Q8WYR1 880 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 DNM3Q9UQ16 869 aa21.47■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC169A6NNP5 214 aa21.46■■□□□ 1.03
CCDC189-201ENST00000433909 E9PMD0 336 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms