RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHC3Q92529 594 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DPH5Q9H2P9 285 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VIPAS39Q9H9C1 493 aa13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GJB1P08034 283 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STRN3Q13033 797 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCTD16Q68DU8 428 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COPS5Q92905 334 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM212AQ96EL1 285 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBXL18Q96ME1 805 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FNBP1Q96RU3 617 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM51Q9BSJ1 452 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MCM3APO60318 1980 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAPN2P17655 700 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RFX1P22670 979 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZBTB33Q86T24 672 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARL8AQ96BM9 186 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF653Q96CK0 615 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIM7Q9C029 511 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RABEP2Q9H5N1 569 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MED4Q9NPJ6 270 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPRFP10586 1907 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PDE6CP51160 858 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPC3P51654 580 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STAT5BP51692 787 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPC5P78333 572 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC125Q86Z20 511 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PASD1Q8IV76 773 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNERQ8NFT8 737 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GLG1Q92896 1179 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZIM3Q96PE6 472 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ISCUQ9H1K1 167 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.63□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WDR90Q96KV7 1748 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MAPK13O15264 365 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DAPK3O43293 454 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CFHP08603 1231 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COMTP21964 271 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLT3P36888 993 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EMBQ6PCB8 327 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CPA5Q8WXQ8 436 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUP85Q9BW27 656 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PORCNQ9H237 461 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UMODL1Q5DID0 1318 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RTN2O75298 545 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNFSF9P41273 254 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAK2Q13177 524 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAPSQ13938 189 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM130Q8N3G9 435 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5B17Q8NGF7 314 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EXOC4Q96A65 974 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R16BQ96T49 567 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HLA-DRAP01903 254 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NF2P35240 595 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PIK3CAP42336 1068 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2W6PQ8NHA6 318 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMC2Q8TDI7 906 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM174Q8WUU8 243 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HVCN1Q96D96 273 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCHPQ9BT92 498 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRPC6Q9Y210 931 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EXTL3O43909 919 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNMDO75829 334 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 STAM2O75886 525 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATG7O95352 703 aa13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms