RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429490.5

SGMS1-203, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 3,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-203ENST00000429490 PIK3CAP42336 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LONP2Q86WA8 852 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CHST7Q9NS84 486 aa14.66□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 DENND3A2RUS2 1198 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP69A5D8W1 941 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MEIS2O14770 477 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MAPK13O15264 365 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RASSF9O75901 435 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RALAP11233 206 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 OVGP1Q12889 678 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TMEM270Q6UE05 265 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RILPQ96NA2 401 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 COG5Q9UP83 839 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 AUHQ13825 339 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SPARCL1Q14515 664 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 P3H1Q32P28 736 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCT6BQ92526 530 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 NPHS2Q9NP85 383 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CASZ1Q86V15 1759 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 IRX4P78413 519 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 TTC17Q96AE7 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.65□□□□□ -0.06
SGMS1-203ENST00000429490 SNX3O60493 162 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CDH16O75309 829 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SLITRK3O94933 977 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 KRT10P13645 584 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 POLE2P56282 527 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PPP3CAQ08209 521 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP61Q8NHU2 1237 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 DONSONQ9NYP3 566 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PFASO15067 1338 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CCDC160A6NGH7 325 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CES2O00748 559 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 KRT39Q6A163 491 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 NLRX1Q86UT6 975 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 C3orf20Q8ND61 904 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PGM2Q96G03 612 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CYTH2Q99418 400 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 MTFR1LQ9H019 292 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 GINM1Q9NU53 330 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 KRT19P08727 400 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ANXA13P27216 316 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 DDR1Q08345 913 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CNGA2Q16280 664 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ACER1Q8TDN7 264 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 MIEF2Q96C03 454 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TRABDQ9H4I3 376 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 DNAJC18Q9H819 358 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 USP21Q9UK80 565 aa14.64□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 H0YGN5 161 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CHKAP35790 457 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SOX10P56693 466 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TTC27Q6P3X3 843 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ERICH1Q86X53 443 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 IWS1Q96ST2 819 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ZWILCHQ9H900 591 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 NFS1Q9Y697 457 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TBX3O15119 743 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 GJB6O95452 261 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 RRM1P23921 792 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ARSEP51690 589 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ATL2Q8NHH9 583 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
SGMS1-203ENST00000429490 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms