RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL13PA6NNM8 815 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 MRE11P49959 708 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ECM1Q16610 540 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 DEPTORQ8TB45 409 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 BHMT2Q9H2M3 363 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 LIMD1Q9UGP4 676 aa23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 PTGESO14684 152 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 ASGR2P07307 311 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 AVPR2P30518 371 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 IFT74Q96LB3 600 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 SNTG2Q9NY99 539 aa23.15■■□□□ 1.3
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RECQL4O94761 1208 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 EDN1P05305 212 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 THP07101 528 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PRPHP41219 470 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TCF15Q12870 199 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PTGDRQ13258 359 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NBR1Q14596 966 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NAB2Q15742 525 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KIF3AQ9Y496 699 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.14■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 MYO10Q9HD67 2058 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TADA2AO75478 443 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 LILRA6Q6PI73 481 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 STAMQ92783 540 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa23.13■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 CLUHO75153 1309 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TGM5O43548 720 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 USP34Q70CQ2 3546 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 B3GALT6Q96L58 329 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 SMOC2Q9H3U7 446 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.12■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KIF4AO95239 1232 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TDGQ13569 410 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RABEP1Q15276 862 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RTP2Q5QGT7 225 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 EEF1DP3Q658K8 133 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.11■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RFPL2O75678 378 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KRT79Q5XKE5 535 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PDXDC1Q6P996 788 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PALB2Q86YC2 1186 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RABGGTAQ92696 567 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TTPALQ9BTX7 342 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 KCNK12Q9HB15 430 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 EPS15L1Q9UBC2 864 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 CACNG4Q9UBN1 327 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DNM3Q9UQ16 869 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF13BQ9Y275 285 aa23.1■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 ST18O60284 1047 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 RILPL1Q5EBL4 403 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DRC1Q96MC2 740 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 USP20Q9Y2K6 914 aa23.09■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 K7ERI5 159 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 LIG1P18858 919 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NPTX2P47972 431 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 DAW1Q8N136 415 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 NXPE3Q969Y0 559 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 UROC1Q96N76 676 aa23.08■■□□□ 1.29
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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