RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPC6Q9Y210 931 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ADM5C9JUS6 153 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP26A1O43174 497 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SPOPO43791 374 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF9O75901 435 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA6P17066 643 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGB5P18084 799 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC47A2Q86VL8 602 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PGM2Q96G03 612 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ACCSQ96QU6 501 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM206Q9H813 350 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CD248Q9HCU0 757 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PODXLO00592 558 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MXI1P50539 228 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MYBPC2Q14324 1141 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 COL20A1Q9P218 1284 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM150BA6NC51 233 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC25Q86WR0 208 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM117Q9H0C3 514 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MMP13P45452 471 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 NSMFQ6X4W1 530 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MOB2Q70IA6 237 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 IL31RAQ8NI17 732 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPTQ96BT3 561 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 NUP85Q9BW27 656 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SCTRP47872 440 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RIT2Q99578 217 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF536O15090 1300 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ATG4CQ96DT6 458 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT17Q9BSW7 474 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 P4HA2O15460 535 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RARAP10276 462 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RARRES1P49788 294 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CD101Q93033 1021 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF653Q96CK0 615 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PARP2Q9UGN5 583 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC16A4O15374 487 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 P4HBP07237 508 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ADRB2P07550 413 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PLS3P13797 630 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCY2Q08462 1091 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 TCEAL1Q15170 157 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC38Q502W7 563 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCT6BQ92526 530 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 HVCN1Q96D96 273 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 RIPK2O43353 540 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 FMO1Q01740 532 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K10Q02779 954 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC197Q8NCU1 140 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 SORBS3O60504 671 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 GGPS1O95749 300 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 IFNAR2P48551 515 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX3P56589 373 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMA4DQ92854 862 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 RIPK3Q9Y572 518 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SBF1O95248 1867 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 AGTP01019 485 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 GZMAP12544 262 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1-202ENST00000417536 SAAL1Q96ER3 474 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms