RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 DNERQ8NFT8 737 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 RIT2Q99578 217 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT3Q9UH03 358 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 FZD1Q9UP38 647 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 USTQ9Y2C2 406 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PKD1L3Q7Z443 1732 aa4.7□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT172Q9UG01 1749 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SFI1A8K8P3 1242 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SYCE1LA8MT33 242 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D8O95759 1140 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MXI1P50539 228 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MYL7Q01449 175 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CRYMQ14894 314 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC41Q15345 812 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAF7Q6Q0C0 670 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CERS5Q8N5B7 392 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GAKO14976 1311 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC15A5A6NIM6 579 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 POTECB2RU33 542 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 VWA5AO00534 786 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 RASGRF2O14827 1237 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC16A4O15374 487 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXA2O43364 376 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MED7O43513 233 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D12O60347 775 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TADA2AO75478 443 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GPC4O75487 556 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CPB1P15086 417 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SERPINB1P30740 379 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 YWHABP31946 246 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SHMT1P34896 483 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 RFC5P40937 340 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF11P52732 1056 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MORC3Q14149 939 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL31Q9H511 634 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TUFT1Q9NNX1 390 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 VTA1Q9NP79 307 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SPDYE5A6NIY4 337 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 SPAG7O75391 227 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CABYRO75952 493 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT6AP02538 564 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT6BP04259 564 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CAPN1P07384 714 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGEA1P43355 309 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT6CP48668 564 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K10Q02779 954 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 GABPAQ06546 454 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 CNGA2Q16280 664 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 JADE1Q6IE81 842 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM50Q86XT4 487 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 BBS5Q8N3I7 341 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 RDM1Q8NG50 284 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM169Q96HH4 297 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR18Q9BV38 432 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 TIPINQ9BVW5 301 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms