RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PODXLO00592 558 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PHF2O75151 1096 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CCNE2O96020 404 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CTNNA2P26232 953 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CNGA1P29973 690 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 LSP1P33241 339 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ZNF844Q08AG5 666 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NLRX1Q86UT6 975 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 VSIG10LQ86VR7 867 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ALG3Q92685 438 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ADRB2P07550 413 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CCND2P30279 289 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ADSSP30520 456 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NPTX2P47972 431 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PEX5P50542 639 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PTPROQ16827 1216 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CD101Q93033 1021 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 KREMEN1Q96MU8 473 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FMO2Q99518 471 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PARP2Q9UGN5 583 aa25.57■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 GARTP22102 1010 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 GJA5P36382 358 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CCT5P48643 541 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FKBP1BP68106 108 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PDCLQ13371 301 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CYP1B1Q16678 543 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.56■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ATP9AO75110 1047 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 SGPL1O95470 568 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CDR2Q01850 454 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FSTL1Q12841 308 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CROCCP2Q86T23 111 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 HELQQ8TDG4 1101 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NT5C1BQ96P26 610 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PCDHB18PQ96TA0 734 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PARP14Q460N5 1801 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 VWA5AO00534 786 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 STAM2O75886 525 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ANO5Q75V66 913 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PPM1EQ8WY54 764 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NR2E1Q9Y466 385 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CSADQ9Y600 493 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NFASCO94856 1347 aa25.55■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NDUFAB1O14561 156 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 NUDT17P0C025 328 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 FMO1Q01740 532 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PTGISQ16647 500 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 SEL1L2Q5TEA6 688 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 C10orf67Q8IYJ2 551 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CDHR1Q96JP9 859 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.54■■□□□ 1.68
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PMS1-205ENST00000409985 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PICK1Q9NRD5 415 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa25.54■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.53■■□□□ 1.68
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PMS1-205ENST00000409985 PTGIRP43119 386 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 GCNT1Q02742 428 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 JAMLQ86YT9 394 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 PPM1KQ8N3J5 372 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 RAB20Q9NX57 234 aa25.53■■□□□ 1.68
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PMS1-205ENST00000409985 DENND3A2RUS2 1198 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CCDC169A6NNP5 214 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 DGAT1O75907 488 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CYP11B1P15538 503 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 ATP1A2P50993 1020 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 SEMA4DQ92854 862 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.53■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 IRF6O14896 467 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 STBD1O95210 358 aa25.52■■□□□ 1.68
PMS1-205ENST00000409985 CPP00450 1065 aa25.52■■□□□ 1.68
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