RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 MAGEB18Q96M61 343 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 BCS1LQ9Y276 419 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 MED7O43513 233 aa10.35□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 NPR1P16066 1061 aa10.35□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 SEMA3FQ13275 785 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 CMTM5Q96DZ9 223 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 SH3GL1Q99961 368 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 POTEEQ6S8J3 1075 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 CCDC103Q8IW40 242 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 XXYLT1Q8NBI6 393 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 CDC26Q8NHZ8 85 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-202ENST00000402738 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.34□□□□□ -0.75
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HERC3-202ENST00000402738 S100A5P33763 92 aa10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-202ENST00000402738 ARL10Q8N8L6 244 aa10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-202ENST00000402738 CEP170P1Q96L14 293 aa10.33□□□□□ -0.76
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF609O15014 1411 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 RTN2O75298 545 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 CYP2D6P10635 497 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 SLC9A1P19634 815 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-202ENST00000402738 COMTP21964 271 aa10.33□□□□□ -0.76
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