RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 HLA-CQ95604 372 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCHPQ9BT92 498 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 STRA6Q9BX79 667 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 VN1R3Q9BXE9 311 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM9Q9C026 710 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MARCH5Q9NX47 278 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 COG5Q9UP83 839 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAN1Q9Y2M0 1017 aa24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 IDEP14735 1019 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CMA1P23946 247 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MCL1Q07820 350 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCF25Q9BQ70 676 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 OLFML3Q9NRN5 406 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ABCD1P33897 745 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 OSTNP61366 133 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TFF2Q03403 129 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NAB2Q15742 525 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 XKR4Q5GH76 650 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALKAL1Q6UXT8 129 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 BICD1Q96G01 975 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PANK4Q9NVE7 773 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HPSEQ9Y251 543 aa24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CLDN3O15551 220 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR1G1P47890 313 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 LIG4P49917 911 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 AMPD3Q01432 767 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUSC3Q13454 348 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PLPP4Q5VZY2 271 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 VPS52Q8N1B4 723 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBP1Q9H171 429 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D7Q9P0N9 293 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACNG4Q9UBN1 327 aa24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1B0GVL5 298 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HIDE1A8MVS5 230 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 F8W810 466 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFEMP2O95967 443 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 THP07101 528 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PFKFB1P16118 471 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CASP5P51878 434 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMC7Q7Z402 723 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 HVCN1Q96D96 273 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SNX27Q96L92 541 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACAP3Q96P50 834 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.09■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NCK2O43639 380 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM189A1O60320 539 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 NRIP1P48552 1158 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 YARSP54577 528 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 COASYQ13057 564 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 DUSP6Q16828 381 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEZ6Q53EL9 994 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 GLRA4Q5JXX5 417 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 ASB2Q96Q27 587 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGFLR1Q9H665 355 aa24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A0B4J269 797 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-20-201ENST00000390606 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1W2PQ27 194 aa24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1W2PQ64 194 aa24.07■■□□□ 1.44
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