RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 ACAP3Q96P50 834 aa16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 CDH23Q9H251 3354 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SPG21Q9NZD8 308 aa16.83■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 KLK14Q9P0G3 267 aa16.82■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 STK39Q9UEW8 545 aa16.82■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 ABLIM1O14639 778 aa16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP42Q96MM3 310 aa16.81■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 TUSC3Q13454 348 aa16.79■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.79■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 COLEC11Q9BWP8 271 aa16.79■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIF20AO95235 890 aa16.78■□□□□ 0.28
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR1G1P47890 313 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC11A1P49279 550 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 CASP5P51878 434 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 DSC1Q08554 894 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-202ENST00000379615 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.78■□□□□ 0.28
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