RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376228.9

HLA-C-201, Transcript of major histocompatibility complex, class I, C, humanhuman

APPRIS P2 BASIC

Gene HLA-C, Length 1,536 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-C-201ENST00000376228 EFNA5P52803 228 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GBP6Q6ZN66 633 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.99■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TISP43B9A030 160 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 P4HA2O15460 535 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 ASAP2O43150 1006 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 SELPP16109 830 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 STRN3Q13033 797 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PPFIA1Q13136 1202 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CAPSQ13938 189 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GANQ9H2C0 597 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TRPC6Q9Y210 931 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 K7ERI5 159 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 MAGEB2O15479 319 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 SLC34A2O95436 690 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 THPOP40225 353 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 FMO5P49326 533 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 IGBP1P78318 339 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GRIK4Q16099 956 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PDXDC1Q6P996 788 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 Q7L0L9 218 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 ZBTB10Q96DT7 871 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 MYO6Q9UM54 1294 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.98■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 NRCAMQ92823 1304 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CCDC175P0C221 793 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GNAT1P11488 350 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PON1P27169 355 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 VAMP7P51809 220 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 ADAM17P78536 824 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 POU5F1BQ06416 359 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GPNMBQ14956 572 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PTPN14Q15678 1187 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TMC2Q8TDI7 906 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 HERVK_113Q902F9 699 aa22.97■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CTSHP09668 335 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 RFC2P35250 354 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 MTF1Q14872 753 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 RASIP1Q5U651 963 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CHP1Q99653 195 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HLA-C-201ENST00000376228 PTPRSQ13332 1948 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 ZBBXA8MT70 800 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 NBNO60934 754 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 C22orf31O95567 290 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 INSRRP14616 1297 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 DRP2Q13474 957 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 ZPBP2Q6X784 338 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 USP20Q9Y2K6 914 aa22.95■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 PFKMP08237 780 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 TNNT1P13805 278 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 SLC9A1P19634 815 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 LIG4P49917 911 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 TFDP1Q14186 410 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 MBTPS1Q14703 1052 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 MARCH8Q5T0T0 291 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 GPD1LQ8N335 351 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 SIX2Q9NPC8 291 aa22.94■■□□□ 1.26
HLA-C-201ENST00000376228 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms