RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXL16Q8N461 479 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NEUROG1Q92886 237 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SETDB2Q96T68 719 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTRCQ99895 268 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPON1Q9HCB6 807 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLEC1BQ9P126 229 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLCA2Q9UQC9 943 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOX1Q9Y5S8 564 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGB4P16144 1822 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC27A2O14975 620 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJC6O75061 913 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJB5O75953 348 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 STC2O76061 302 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IGLV2-11P01706 119 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLS3P13797 630 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD247P20963 164 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ME1P48163 572 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LTBQ06643 244 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MOGSQ13724 837 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 INF2Q27J81 1249 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPY19L1Q2PZI1 675 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NBPF8Q3BBV2 869 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF15Q66K64 600 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRAMD4Q6IC98 578 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSTYKQ6XUX3 929 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIP4P1Q86T03 277 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 THNSL2Q86YJ6 484 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RASAL3Q86YV0 1011 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIAA0825Q8IV33 1275 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FBXL14Q8N1E6 418 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR48Q8TAF3 677 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CUL5Q93034 780 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNX27Q96L92 541 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NODALQ96S42 347 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CNNM2Q9H8M5 875 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PELI2Q9HAT8 420 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 COG6Q9Y2V7 657 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BDP1A6H8Y1 2624 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf78A6NCI8 922 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KLLNB2CW77 178 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MPPED1O15442 326 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT36O76013 467 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 JUNP05412 331 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ELFN1P0C7U0 828 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKMP14618 531 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC25CP30307 473 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DLX5P56178 289 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CD83Q01151 205 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP2R5DQ14738 602 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHPFQ8IZ52 775 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CMTM4Q8IZR5 234 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DHRS1Q96LJ7 313 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM129BQ96TA1 746 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTBD2Q9BX70 525 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM55Q9BYV6 548 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM74BQ9NUR3 256 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NCDNQ9UBB6 729 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BRPF3Q9ULD4 1205 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HDAC5Q9UQL6 1122 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUB1Q9Y5A7 615 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR17Q8IZU2 1322 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DENND3A2RUS2 1198 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9IYK1 514 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PGGT1BP53609 377 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AMPD2Q01433 879 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DSC2Q02487 901 aa-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms