RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 RESP18Q5W5W9 173 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TMC7Q7Z402 723 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ZBP1Q9H171 429 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CLDND1Q9NY35 253 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TBX20Q9UMR3 447 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 FAN1Q9Y2M0 1017 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 VCANP13611 3396 aa16.37■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 H3BQ06 376 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TBX10O75333 385 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TOM1L1O75674 476 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 MCF2P10911 925 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 LTBRP36941 435 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 KRT85P78386 507 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 RBM10P98175 930 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 NAB2Q15742 525 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 SEZ6Q53EL9 994 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 VPS52Q8N1B4 723 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 RABGGTAQ92696 567 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 BICD1Q96G01 975 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TCHPQ9BT92 498 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.36■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 GLP2RO95838 553 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PIGRP01833 764 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ALDH2P05091 517 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 IDEP14735 1019 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2BQ00403 316 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 MCL1Q07820 350 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM15Q13444 863 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 DUSP6Q16828 381 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ZPBP2Q6X784 338 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA32Q96LK8 384 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TNMDQ9H2S6 317 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 IKZF4Q9H2S9 585 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TLE6Q9H808 572 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.35■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CARNS1A5YM72 827 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TISP43B9A030 160 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R37O75864 691 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 THP07101 528 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CASP1P29466 404 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CA8P35219 290 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 LIG4P49917 911 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TUSC3Q13454 348 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TAS1R1Q7RTX1 841 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 EFHBQ8N7U6 833 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 SNX27Q96L92 541 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 STRA6Q9BX79 667 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM9Q9C026 710 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 CUEDC2Q9H467 287 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 GDPD2Q9HCC8 539 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 FAM13BQ9NYF5 915 aa16.34■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TCHHQ07283 1943 aa16.33■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 TRIP11Q15643 1979 aa16.33■□□□□ 0.21
CSAG1-201ENST00000361211 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLDN3O15551 220 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 EFEMP2O95967 443 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MYBP10242 640 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CTSAP10619 480 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 BMP1P13497 986 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 GAP43P17677 238 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CASP5P51878 434 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 KCNA1Q09470 495 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 COASYQ13057 564 aa16.33■□□□□ 0.2
CSAG1-201ENST00000361211 CLUL1Q15846 466 aa16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms