RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 TTC25Q96NG3 672 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DFFAO00273 331 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.35■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 C19orf81C9J6K1 198 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 MS4A14Q96JA4 679 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 NR3C2P08235 984 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SP110Q9HB58 689 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DGAT1O75907 488 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CTSHP09668 335 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SCP2P22307 547 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KLHL38Q2WGJ6 581 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KRT38O76015 456 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RHOBTB3O94955 611 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 EMC2Q15006 297 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.34■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 SRGNP10124 158 aa22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 TAF11Q15544 211 aa22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 KLK7P49862 253 aa22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF560Q96MR9 790 aa22.33■■□□□ 1.17
SMURF1-201ENST00000361125 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 AP5Z1O43299 807 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SPON1Q9HCB6 807 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 DONSONQ9NYP3 566 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 HACL1Q9UJ83 578 aa22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 KRT17Q04695 432 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 STYK1Q6J9G0 422 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RUBCNQ92622 972 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TIPINQ9BVW5 301 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SNX2O60749 519 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 MX2P20592 715 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 FMO5P49326 533 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RGS7P49802 495 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 PRKCEQ02156 737 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 MORC4Q8TE76 937 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SMIM24O75264 130 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 GRIK1P39086 918 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SULT1E1P49888 294 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 KYAT1Q16773 422 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 APOL1O14791 398 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 HIPK4Q8NE63 616 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 AMACRQ9UHK6 382 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SNAPC2Q13487 334 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TKFCQ3LXA3 575 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TTC30BQ8N4P2 665 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.32■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TBX3O15119 743 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 GYPCP04921 128 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 NCAPHQ15003 741 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 H3BRJ5 948 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 TRPA1O75762 1119 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 COPS2P61201 443 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 POU5F1BQ06416 359 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ARSEP51690 589 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 RAET1EQ8TD07 263 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 SPAG7O75391 227 aa22.31■■□□□ 1.16
SMURF1-201ENST00000361125 GRIN1Q05586 938 aa22.31■■□□□ 1.16
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