RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PTPROQ16827 1216 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 RPAINQ86UA6 219 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SLC26A7Q8TE54 656 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 INTUQ9ULD6 942 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 KAT6AQ92794 2004 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 GMNCA6NCL1 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 APOA1P02647 267 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PCSK1P29120 753 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CDC27P30260 824 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HSPA13P48723 471 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 GTF2H3Q13889 308 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 BANK1Q8NDB2 785 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CASZ1Q86V15 1759 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CDO1Q16878 200 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 C16orf89Q6UX73 402 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SORBS3O60504 671 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ESRRBO95718 433 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 FLT1P17948 1338 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CXCR5P32302 372 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CD302Q8IX05 232 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ZBED8Q8IZ13 594 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 TSC22D3Q99576 134 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 NEMP1O14524 444 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF9O43307 516 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 RTN2O75298 545 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 GPS1Q13098 491 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 APPL2Q8NEU8 664 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 MYO9BQ13459 2157 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PQJ5 194 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 TPI1P60174 286 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GTH6 734 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 TRPA1O75762 1119 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CYBBP04839 570 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 MYL3P08590 195 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2ADP20671 130 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 STKLD1Q8NE28 680 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 WRNIP1Q96S55 665 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 ABCB6Q9NP58 842 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 KRT87PA6NCN2 255 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L15C9J2P7 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L11C9JVI0 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L18D6R9N7 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L22D6RA61 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L19D6RCP7 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L20D6RJB6 530 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 UBXN2AP68543 259 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CYP27A1Q02318 531 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 USP17L24Q0WX57 530 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRT-201ENST00000356100 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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PTPRT-201ENST00000356100 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 DIAPH2O60879 1101 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-201ENST00000356100 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
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