RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 CTAGE9A4FU28 777 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PJA2O43164 708 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TOMM70O94826 608 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 VTNP04004 478 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 FCGRTP55899 365 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SEZ6Q53EL9 994 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SETD4Q9NVD3 440 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 Q9Y3F1 56 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MACROD2A1Z1Q3 448 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ABLIM1O14639 778 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 B4GALT5O43286 388 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 FAM189A1O60320 539 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 F2P00734 622 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 IQCF3P0C7M6 154 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PROZP22891 400 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PSMC4P43686 418 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 VPS36Q86VN1 386 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KAT2BQ92831 832 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 AP5M1Q9H0R1 490 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 OGTO15294 1046 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CTIFO43310 598 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CPT1AP50416 773 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CHMP4BP1P59074 171 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NOGQ13253 232 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ZACNQ401N2 412 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.73■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TNFSF9P41273 254 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MFAP3P55082 362 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KAT5Q92993 513 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 FAM84AQ96KN4 292 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NT5C1BQ96P26 610 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MAP7D2Q96T17 732 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PTPRJQ12913 1337 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NRCAMQ92823 1304 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 FAM187BQ17R55 369 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 HELQQ8TDG4 1101 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KAT6AQ92794 2004 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CGRRF1Q99675 332 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NAGPAQ9UK23 515 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.72■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 DYNC1I1O14576 645 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 AOC2O75106 756 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KIF22Q14807 665 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NAB2Q15742 525 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 NLRP7Q8WX94 980 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MGAMO43451 1857 aa20.71■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ZEB2O60315 1214 aa20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 AKR1A1P14550 325 aa20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 MFSD10Q14728 455 aa20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 GABRQQ9UN88 632 aa20.7■□□□□ 0.91
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D8O95759 1140 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 BEX3Q00994 111 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 BIRC3Q13489 604 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 AMHR2Q16671 573 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 TSC1Q92574 1164 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 TATDN2Q93075 761 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 SYT11Q9BT88 431 aa20.7■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 HLA-DRAP01903 254 aa20.69■□□□□ 0.9
UPP1-201ENST00000331803 MYL3P08590 195 aa20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.3 ms