RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.19■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 TMC2Q8TDI7 906 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC114Q96M63 670 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FAM170AA1A519 330 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FSCN2O14926 492 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ECEL1O95672 775 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GTF2H1P32780 548 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PDE6CP51160 858 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ITIH4Q14624 930 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC197Q8NCU1 140 aa24.18■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 WHRNQ9P202 907 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CLRN2A0PK11 232 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SLC16A4O15374 487 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ADSSP30520 456 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 POTEAQ6S8J7 498 aa24.18■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FBXL18Q96ME1 805 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SELENOSQ9BQE4 189 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PLVAPQ9BX97 442 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 NFIBO00712 420 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PLSCR1O15162 318 aa24.17■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 PEX3P56589 373 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 PPARDQ03181 441 aa24.17■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 RASGRF2O14827 1237 aa24.16■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FGFR4P22455 802 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 XRCC4Q13426 336 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR1Q13613 665 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 AUHQ13825 339 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa24.16■■□□□ 1.46
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HOXD1-201ENST00000331462 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 KIFAP3Q92845 792 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ACP6Q9NPH0 428 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TP73O15350 636 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 JAK3P52333 1124 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CALCOCO2Q13137 446 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 DLGAP5Q15398 846 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 UGCGQ16739 394 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 BTBD6Q96KE9 485 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GPRC5CQ9NQ84 441 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CHUKO15111 745 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 GSTA1P08263 222 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MAN1A1P33908 653 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K10Q02779 954 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 FUKQ8N0W3 1084 aa24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
HOXD1-201ENST00000331462 SFNP31947 248 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 USP37Q86T82 979 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.14■■□□□ 1.45
HOXD1-201ENST00000331462 SPIRE2Q8WWL2 714 aa24.14■■□□□ 1.45
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