RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 MUTP22033 750 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RAD23BP54727 409 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RHBDL3P58872 404 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GABPAQ06546 454 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KLC1Q07866 573 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNA1Q09470 495 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CBWD6Q4V339 395 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CBWD3Q5JTY5 395 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CBWD5Q5RIA9 395 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TMEM63BQ5T3F8 832 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CCDC25Q86WR0 208 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SLC9A9Q8IVB4 645 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GDAP1Q8TB36 358 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TMEM174Q8WUU8 243 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 IFT43Q96FT9 208 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM20AQ96MK3 541 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LRRC37BQ96QE4 947 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NUDCD1Q96RS6 583 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ANO3Q9BYT9 981 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NYXQ9GZU5 481 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DCLRE1BQ9H816 532 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 BTG4Q9NY30 223 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FAM47DPA6NHR8 397 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CYP1A2P05177 515 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 T-ENOLP0DO92 83 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ALDH3A1P30838 453 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 WDR4P57081 412 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 IRGCQ6NXR0 463 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MTHFD1LQ6UB35 978 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RNF207Q6ZRF8 634 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KRT27Q7Z3Y8 459 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZNF804AQ7Z570 1209 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CYP4X1Q8N118 509 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CNBD1Q8NA66 436 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNV2Q8TDN2 545 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DENND1AQ8TEH3 1009 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MAML1Q92585 1016 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LENG9Q96B70 501 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ERP27Q96DN0 273 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RUSC1Q9BVN2 902 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TRAIPQ9BWF2 469 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PLVAPQ9BX97 442 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SAR1AQ9NR31 198 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NINJ2Q9NZG7 142 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SEL1LQ9UBV2 794 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PTPN22Q9Y2R2 807 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZNF536O15090 1300 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FOCADQ5VW36 1801 aa12.04□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RSPH10B2B2RC85 870 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 P4HA2O15460 535 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RSPH10BP0C881 870 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TM4SF1P30408 202 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PCK1P35558 622 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CHKAP35790 457 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNJ1P48048 391 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MYL7Q01449 175 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KRT17Q04695 432 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D9BQ66K14 1250 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 VSIG1Q86XK7 387 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TDRPQ86YL5 185 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 ZNF398Q8TD17 642 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 DNAJC9Q8WXX5 260 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SYT15Q9BQS2 421 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CCDC77Q9BR77 488 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 FOXP3Q9BZS1 431 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 UVRAGQ9P2Y5 699 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KCNG1Q9UIX4 513 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GAKO14976 1311 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SIGLEC16A6NMB1 481 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 THAP12O43422 761 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GSTA2P09210 222 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RPS6KA3P51812 740 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 MXRA7P84157 204 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 OCRLQ01968 901 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 KYNUQ16719 465 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SLC45A4Q5BKX6 768 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 RINT1Q6NUQ1 792 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 CEP128Q6ZU80 1094 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 GRK7Q8WTQ7 553 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.03□□□□□ -0.48
GINS3-202ENST00000328514 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms