RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 SLC25A27O95847 323 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 STAT5BP51692 787 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CLDN10P78369 228 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 FMO1Q01740 532 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CDR2Q01850 454 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 C11orf63Q6NUN7 778 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 TATDN2Q93075 761 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 NFU1Q9UMS0 254 aa23.41■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 RNF40O75150 1001 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CNMDO75829 334 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 MMEP08473 750 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 METTL7BQ6UX53 244 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 CARD9Q9H257 536 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 ACP6Q9NPH0 428 aa23.4■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 AGPSO00116 658 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 GGPS1O95749 300 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 NF2P35240 595 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF516Q92618 1163 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 ALG6Q9Y672 507 aa23.39■■□□□ 1.34
SPHK1-201ENST00000323374 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.39■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.39■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 TNNI1P19237 187 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.334e-8■■■■□ 22.9
SPHK1-201ENST00000323374 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 SPON1Q9HCB6 807 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MTA2O94776 668 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 FGGP02679 453 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ACOT2P49753 483 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 LY6KQ17RY6 165 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ZACNQ401N2 412 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 WDR44Q5JSH3 913 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ALS2CLQ60I27 953 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 AZI2Q9H6S1 392 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.38■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 CLSTN1O94985 981 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 KRT5P13647 590 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 COPB2P35606 906 aa23.37■■□□□ 1.33
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SPHK1-201ENST00000323374 CLUL1Q15846 466 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DCAF12L1Q5VU92 463 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC26Q8TAB7 109 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 WHAMMQ8TF30 809 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 CDCA5Q96FF9 252 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 FAM167AQ96KS9 214 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MSTO1Q9BUK6 570 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 PPME1Q9Y570 386 aa23.37■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ITGA4P13612 1032 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 19.5
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SPHK1-201ENST00000323374 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MORC4Q8TE76 937 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 RPS6KC1Q96S38 1066 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 HAPLN2Q9GZV7 340 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 HSF2BPO75031 334 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 PPIL2Q13356 520 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 CUL1Q13616 776 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MOB2Q70IA6 237 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 GTF3C4Q9UKN8 822 aa23.36■■□□□ 1.33
SPHK1-201ENST00000323374 A0A0B4J269 797 aa23.35■■□□□ 1.33
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