RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296786.7

UBLCP1-201, Transcript of ubiquitin like domain containing CTD phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBLCP1, Length 2,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1-201ENST00000296786 TMEM132BQ14DG7 1078 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TUBB8Q3ZCM7 444 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 EMC10Q5UCC4 262 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SV2AQ7L0J3 742 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GPD1LQ8N335 351 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TMC2Q8TDI7 906 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF653Q96CK0 615 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 BTBD6Q96KE9 485 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 RPS6KC1Q96S38 1066 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 FMO2Q99518 471 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ERP44Q9BS26 406 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 NUP85Q9BW27 656 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PDLIM7Q9NR12 457 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PICK1Q9NRD5 415 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TRPC6Q9Y210 931 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZEB2O60315 1214 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DSG3P32926 999 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 BAG6P46379 1132 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 OAZ1P54368 228 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CDR2Q01850 454 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DUPD1Q68J44 220 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 USP37Q86T82 979 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CPNE8Q86YQ8 564 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 JAMLQ86YT9 394 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 MCPH1Q8NEM0 835 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CD101Q93033 1021 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TATDN2Q93075 761 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 C18orf8Q96DM3 657 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 BICD1Q96G01 975 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 FAM84AQ96KN4 292 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PI4K2AQ9BTU6 479 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CYP26B1Q9NR63 512 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CYP39A1Q9NYL5 469 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZNF112Q9UJU3 913 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 NFASCO94856 1347 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 MYO1FO00160 1098 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PHF2O75151 1096 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CYP1A2P05177 515 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GTF2H1P32780 548 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ACTR2P61160 394 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GTF3C4Q9UKN8 822 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 FAM187AA6NFU0 413 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SPOPO43791 374 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZBTB7AO95365 584 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CALCAP01258 141 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PYGMP11217 842 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 HSPA6P17066 643 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GARTP22102 1010 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CTNNA2P26232 953 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 LSP1P33241 339 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 RTP1P59025 263 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 MTERF2Q49AM1 385 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PRELID2Q8N945 189 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 MORC4Q8TE76 937 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CDHR1Q96JP9 859 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 IFT74Q96LB3 600 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 C12orf42Q96LP6 360 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TEX13BQ9BXU2 312 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ACAD9Q9H845 621 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.99□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 EBAG9O00559 213 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GRIN3BO60391 1043 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PPFIA2O75334 1257 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 KRT5P13647 590 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 CHRNA3P32297 505 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 GCNT1Q02742 428 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TTC27Q6P3X3 843 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 RUFY4Q6ZNE9 571 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 UVRAGQ9P2Y5 699 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 RASAL2Q9UJF2 1139 aa9.98□□□□□ -0.81
UBLCP1-201ENST00000296786 SNX24Q9Y343 169 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms