RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 CEP120Q8N960 986 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 ACAP3Q96P50 834 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.751e-7■■■■■ 26.8
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 UBN1Q9NPG3 1134 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 TRIP11Q15643 1979 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF233A6NK53 670 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 SMTNL1A8MU46 457 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 ITGA4P13612 1032 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 HES2Q9Y543 173 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC39A3-201ENST00000269740 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 GNA14O95837 355 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CEP135Q66GS9 1140 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CRIPAKQ8N1N5 446 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 HERVK_113Q902F9 699 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 THAP9Q9H5L6 903 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 SNTG2Q9NY99 539 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 AKAP3O75969 853 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 AMHP03971 560 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 TNFSF9P41273 254 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 OSTNP61366 133 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 IQCB1Q15051 598 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 SEZ6Q53EL9 994 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CBWD2Q8IUF1 395 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ANK1P16157 1881 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ADRB2P07550 413 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 EPB41P11171 864 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 KCNJ6P48051 423 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CASP4P49662 377 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 NCAPHQ15003 741 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.744e-11■■■■■ 33
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SLC39A3-201ENST00000269740 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CD302Q8IX05 232 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RDH13Q8NBN7 331 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RSPH1Q8WYR4 309 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RNF39Q9H2S5 420 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CBX8Q9HC52 389 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 BECN2A8MW95 431 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 H0YGN5 161 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RECQL4O94761 1208 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ENPEPQ07075 957 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 AGMOQ6ZNB7 445 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM114A1Q8IWE2 563 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 TMEM192Q8IY95 271 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 TOP1MTQ969P6 601 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 GDF15Q99988 308 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 PARP2Q9UGN5 583 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 HOXA2O43364 376 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 AKAP5P24588 427 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 SURF1Q15526 300 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC10A6Q3KNW5 377 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 FRMD5Q7Z6J6 570 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 APOL6Q9BWW8 343 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 ASB7Q9H672 318 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 RSAD1Q9HA92 442 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 TTC26A0AVF1 554 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 IL18RAPO95256 599 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CXCL8P10145 99 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC39A3-201ENST00000269740 CYP24A1Q07973 514 aa25.91■■□□□ 1.74
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