RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 ARPC5LQ9BPX5 153 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TCP11X1B4DZS4 312 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 FTCDO95954 541 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 SLC15A3Q8IY34 581 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TTC8Q8TAM2 541 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DISC1Q9NRI5 854 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.41■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ADCY7P51828 1080 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 AZI2Q9H6S1 392 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 NYAP2Q9P242 653 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 GDAQ9Y2T3 454 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TMED5Q9Y3A6 229 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LYNP07948 512 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 FUT4P22083 530 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DNA2P51530 1060 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 UBE2SQ16763 222 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.4■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 LAD1O00515 517 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 ENTPD3O75355 529 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 OR52Z1P0C646 297 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 NAT1P18440 290 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 MLH1P40692 756 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 TAF4BQ92750 862 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 EPB41L4BQ9H329 900 aa23.39■■□□□ 1.34
PITX1-201ENST00000265340 CCDC188H7C350 402 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB5O15062 677 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GRIN3BO60391 1043 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CDK7P50613 346 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CCDC6Q16204 474 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMEM259Q4ZIN3 620 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLFN13Q68D06 897 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GPC2Q8N158 579 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CSRNP1Q96S65 589 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.39■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 WNT10BO00744 389 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 VARSP26640 1264 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RTP1P59025 263 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MGAT5Q09328 741 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TAOK1Q7L7X3 1001 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NAT14Q8WUY8 206 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TRIM47Q96LD4 638 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ATP9BO43861 1147 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 HOXD12P35452 270 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 UBA7P41226 1012 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC1A4P43007 532 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 EHHADHQ08426 723 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ADCY1Q08828 1119 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NAB2Q15742 525 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 HAUS1Q96CS2 278 aa23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 BTBD19C9JJ37 291 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 ENTPD5O75356 428 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TDP2O95551 362 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 EYA4O95677 639 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 GH2P01242 217 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 NEK9Q8TD19 979 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 FMO2Q99518 471 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 CCSER1Q9C0I3 900 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 RIC8AQ9NPQ8 531 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 SLC37A4O43826 429 aa23.37■■□□□ 1.33
PITX1-201ENST00000265340 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms