RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZNF577Q9BSK1 485 aa16■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RTN2O75298 545 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PIGBQ92521 554 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 KRT4P19013 534 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PTPN4P29074 926 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 NCALDP61601 193 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DSG1Q02413 1049 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 HIF1AQ16665 826 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ARMC3Q5W041 872 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CNBD1Q8NA66 436 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 BTBD6Q96KE9 485 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MYLK2Q9H1R3 596 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 USP32Q8NFA0 1604 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ABCB11O95342 1321 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 WNT7AO00755 349 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CSF1RP07333 972 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 VAMP7P51809 220 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ICA1Q05084 483 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CYFIP1Q7L576 1253 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 XXYLT1Q8NBI6 393 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 REEP2Q9BRK0 252 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SERPINB13Q9UIV8 391 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.99■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 POLR2MP0CAP2 368 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PEX5P50542 639 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ERFEQ4G0M1 354 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RHOT1Q8IXI2 618 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 NEO1Q92859 1461 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 USP17L10C9JJH3 530 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 KRT34O76011 436 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CENPTQ96BT3 561 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 FAM81BQ96LP2 452 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZSWIM1Q9BR11 485 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RPS6KA2Q15349 733 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CNGA2Q16280 664 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MIIPQ5JXC2 388 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 IRGCQ6NXR0 463 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 TLR3O15455 904 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZBED4O75132 1171 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 STAT2P52630 851 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZNF394Q53GI3 561 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ADCY3O60266 1144 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 KRT38O76015 456 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PSEN1P49768 467 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 PEX3P56589 373 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 KCTD6Q8NC69 237 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CYP39A1Q9NYL5 469 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 FAM196BA6NMK8 535 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MGRN1O60291 552 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 UNC5CO95185 931 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 TTC4O95801 387 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CASP4P49662 377 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DCLK2Q8N568 766 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 FAF2Q96CS3 445 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 SORBS3O60504 671 aa15.96■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 FNTAP49354 379 aa15.96■□□□□ 0.15
CASC3-201ENST00000264645 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms