RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 TRPA1O75762 1119 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 IQCF3P0C7M6 154 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 FERP16591 822 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ANXA13P27216 316 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SOX5P35711 763 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP25P42331 645 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CAP1Q01518 475 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 AMHR2Q16671 573 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 BRSK2Q8IWQ3 736 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF516Q92618 1163 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 LZTFL1Q9NQ48 299 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 RAB20Q9NX57 234 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF263O14978 683 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SURF1Q15526 300 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZBTB33Q86T24 672 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 NLRP7Q8WX94 980 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SEMA4DQ92854 862 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CGRRF1Q99675 332 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SPC25Q9HBM1 224 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SRRDQ9UH36 339 aa18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0U1RQJ8 604 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 B4GALT5O43286 388 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC172P0C7W6 258 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 RARBP10826 455 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GNAT1P11488 350 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TNNI1P19237 187 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 HOXC8P31273 242 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 VAV2P52735 878 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 AP3M2P53677 418 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TERF1P54274 439 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 WNT7BP56706 349 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ARID5AQ03989 594 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF568Q3ZCX4 644 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZACNQ401N2 412 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 KIAA1328Q86T90 577 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ATRIPQ8WXE1 791 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF592Q92610 1267 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GPR88Q9GZN0 384 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 KIF5CO60282 957 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GNRH1P01148 92 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CYP2C9P11712 490 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CHMP4BP1P59074 171 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CYP27A1Q02318 531 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SLC18A3Q16572 532 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GNASQ5JWF2 1037 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ARHGEF19Q8IW93 802 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF710Q8N1W2 664 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TXLNBQ8N3L3 684 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 FAM81BQ96LP2 452 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 SCLT1Q96NL6 688 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 DNAI1Q9UI46 699 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.16■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 C17orf102A2RUQ5 167 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 MYADML2A6NDP7 307 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 KRT86O43790 486 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 LRRN2O75325 713 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GPR32O75388 356 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 MCF2P10911 925 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TNFSF9P41273 254 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 VEGFBP49765 207 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GNG11P61952 73 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 PTK2Q05397 1052 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM32Q13049 653 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 HIC1Q14526 733 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 NT5C1BQ96P26 610 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 CDT1Q9H211 546 aa18.15■□□□□ 0.5
TVP23C-201ENST00000225576 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TVP23C-201ENST00000225576 EVI5O60447 810 aa18.14■□□□□ 0.49
TVP23C-201ENST00000225576 GFPT2O94808 682 aa18.14■□□□□ 0.49
TVP23C-201ENST00000225576 MFAP3P55082 362 aa18.14■□□□□ 0.49
TVP23C-201ENST00000225576 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TVP23C-201ENST00000225576 KYAT1Q16773 422 aa18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 261 ms