RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ANO7Q6IWH7 933 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC18Q9H819 358 aa21.98■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 DPPA5A6NC42 116 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RPA1P27694 616 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CD101Q93033 1021 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TBCAO75347 108 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 TAC1P20366 129 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 ATP4AP20648 1035 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 STX2P32856 288 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CYP2J2P51589 502 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 MTFR1Q15390 333 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 KYNUQ16719 465 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 EGFL6Q8IUX8 553 aa21.97■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 APBA3O96018 575 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TARSP26639 723 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 CALCOCO2Q13137 446 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SLC30A10Q6XR72 485 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 C1orf54Q8WWF1 131 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TRIM7Q9C029 511 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 KRT17Q04695 432 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SNX1Q13596 522 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 RNF207Q6ZRF8 634 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 PRUNE1Q86TP1 453 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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PMS1-222ENST00000639501 RGL1Q9NZL6 768 aa21.96■■□□□ 1.11
PMS1-222ENST00000639501 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.95■■□□□ 1.1
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PMS1-222ENST00000639501 SLURP2P0DP57 97 aa21.95■■□□□ 1.1
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PMS1-222ENST00000639501 TTC4O95801 387 aa21.94■■□□□ 1.1
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PMS1-222ENST00000639501 ACVR2BQ13705 512 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-222ENST00000639501 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-222ENST00000639501 RDH13Q8NBN7 331 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-222ENST00000639501 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PMS1-222ENST00000639501 RPS6KC1Q96S38 1066 aa21.93■■□□□ 1.1
PMS1-222ENST00000639501 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.93■■□□□ 1.1
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