RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SUN2	Q9UH99	717 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.85	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PDLIM1	O00151	329 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF40	O75150	1001 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TMOD1	P28289	359 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX19	P40855	299 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	RABGGTB	P53611	331 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EPHB4	P54760	987 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PEX3	P56589	373 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PADI6	Q6TGC4	694 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF365	Q70YC5	407 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GPBP1	Q86WP2	473 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MTMR9	Q96QG7	549 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF24	Q9UPV7	400 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	PLXNB2	O15031	1838 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	HBP1	O60381	514 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GNAT1	P11488	350 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SFN	P31947	248 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	DNM2	P50570	870 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNB1	Q14721	858 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CASP8	Q14790	479 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	EPHA7	Q15375	998 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	XKR3	Q5GH77	459 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	BICD1	Q96G01	975 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	HES2	Q9Y543	173 aa		7.84	□□□□□ -1.15
LETMD1-238	ENST00000623495	ZSCAN12	O43309	604 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	OPA1	O60313	960 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CKB	P12277	381 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAPPC10	P48553	1259 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	DBN1	Q16643	649 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CABYR	O75952	493 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOG	P15173	224 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP3A7	P24462	503 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PBX3	P40426	434 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ASIC1	P78348	528 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB2A	Q13885	445 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	EMC2	Q15006	297 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC39A14	Q15043	492 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB33	Q86T24	672 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPH3	Q86UC2	560 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MYCT1	Q8N699	235 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CPB2	Q96IY4	423 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16

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