RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CEP170P1Q96L14 293 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 KIF20AO95235 890 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GUCD1Q96NT3 240 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 WDR24Q96S15 920 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PTPRSQ13332 1948 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NPEPPSP55786 919 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED6P86452 979 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PAK2Q13177 524 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MAN2A1Q16706 1144 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GPBP1Q86WP2 473 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NEK9Q8TD19 979 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SCLT1Q96NL6 688 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PADI3Q9ULW8 664 aa23.5■■□□□ 1.35
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SGMS1-210ENST00000619438 UPP2O95045 317 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 VWA3BQ502W6 1294 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 EXOC8Q8IYI6 725 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 OSMRQ99650 979 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 DNM3Q9UQ16 869 aa23.49■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 KIF5CO60282 957 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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SGMS1-210ENST00000619438 XKR9Q5GH70 373 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ODR4Q5SWX8 454 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CEP63Q96MT8 703 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GJB5O95377 273 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CA3P07451 260 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TUBB2AQ13885 445 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ARSHQ5FYA8 562 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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SGMS1-210ENST00000619438 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NDST4Q9H3R1 872 aa23.48■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SIP14410 1827 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ENPP3O14638 875 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB39O15060 712 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GPR182O15218 404 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GPR32O75388 356 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NDUFA10O95299 355 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CDC42EP1Q00587 391 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 WDR59Q6PJI9 974 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 POTEGQ6S5H5 508 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 LINC01465Q8N7H1 131 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NLRP7Q8WX94 980 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 EVPLQ92817 2033 aa23.47■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 GNA14O95837 355 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MUTP22033 750 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 TOP1MTQ969P6 601 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CEP89Q96ST8 783 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PPME1Q9Y570 386 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.46■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 MYO9BQ13459 2157 aa23.45■■□□□ 1.35
SGMS1-210ENST00000619438 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 DRP2Q13474 957 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 GRIN2CQ14957 1233 aa23.45■■□□□ 1.34
SGMS1-210ENST00000619438 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.45■■□□□ 1.34
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