RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 RANBP1P43487 201 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 USP11P51784 963 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PDIA5Q14554 519 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NOD2Q9HC29 1040 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDE1Q9NXR1 346 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NAGPAQ9UK23 515 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ENO1P06733 434 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNA15P30679 374 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAPGEF5Q92565 580 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM81BQ96LP2 452 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 BAG5Q9UL15 447 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FMO5P49326 533 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PACS2Q86VP3 889 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 USP31Q70CQ4 1352 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PIK3R2O00459 728 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 TTI2Q6NXR4 508 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATL2Q8NHH9 583 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 MTMR8Q96EF0 704 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 GNGT2O14610 69 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 P3H1Q32P28 736 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXL13Q8NEE6 735 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RASSF10A6NK89 507 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 STXBP3O00186 592 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSF1RP07333 972 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NR1H3Q13133 447 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NTRK3Q16288 839 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 STK33Q9BYT3 514 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLC2Q9H0B6 622 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 APEX2Q9UBZ4 518 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CSADQ9Y600 493 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NCAPD2Q15021 1401 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SETSIPP0DME0 302 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 POLD1P28340 1107 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CAV1Q03135 178 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 DRP2Q13474 957 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FGD4Q96M96 766 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 STK32BQ9NY57 414 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CAND2O75155 1236 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CRKP46108 304 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 HIF1AQ16665 826 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RASSF3Q86WH2 238 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLC1Q07866 573 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 OVGP1Q12889 678 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 DNAJC7Q99615 494 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 MED7O43513 233 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 TTC25Q96NG3 672 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SERPINI1Q99574 410 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 KRT34O76011 436 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM153BP0C7A2 387 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACOT2P49753 483 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM153CQ494X1 144 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS6KC1-208ENST00000614059 THTPAQ9BU02 230 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms