RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989		M0R296	226 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	B4GALT3	O60512	393 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	EYA4	O95677	639 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRKCB	P05771	671 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	NAMPT	P43490	491 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	OR1G1	P47890	313 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	SCNN1G	P51170	649 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	CUL4A	Q13619	759 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZFP42	Q96MM3	310 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	FZD8	Q9H461	694 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	NRP1	O14786	923 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	N4BP3	O15049	544 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	GFRA3	O60609	400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	PEX3	P56589	373 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	COASY	Q13057	564 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNK18	Q7Z418	384 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBP1	Q9H171	429 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NEDD4L-233	ENST00000591989	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989		K7ERI5	159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACKR2	O00590	384 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	HIP1R	O75146	1068 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	NR1I2	O75469	434 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CTSA	P10619	480 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CABP7	Q86V35	215 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PNMA5	Q96PV4	448 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM186A	A6NE01	2351 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	C2CD2L	O14523	706 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	EDN1	P05305	212 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDC	P20941	246 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	UBA7	P41226	1012 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	EFNA5	P52803	228 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZXDA	P98168	799 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	GIT2	Q14161	759 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CASP10	Q92851	521 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLA2G4B	P0C869	781 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	NPTX2	P47972	431 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNC3	Q14003	757 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	CALML4	Q96GE6	196 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NEDD4L-233	ENST00000591989	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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