RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RSPH3Q86UC2 560 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 VPS36Q86VN1 386 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC42Q96M95 316 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CRACR2AQ9BSW2 395 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OGTO15294 1046 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP2C9P11712 490 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ANXA13P27216 316 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 DRP2Q13474 957 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SPA17Q15506 151 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PTPN14Q15678 1187 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PDXDC1Q6P996 788 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CBWD2Q8IUF1 395 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM139Q8IV31 216 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PARD3BQ8TEW8 1205 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ADCY6O43306 1168 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CABYRO75952 493 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SERPING1P05155 500 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KLK7P49862 253 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MCL1Q07820 350 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ASIC2Q16515 512 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SETD4Q9NVD3 440 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KAT6AQ92794 2004 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TISP43B9A030 160 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QZ92 97 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 OFD1O75665 1012 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM49P0CI25 452 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM49CP0CI26 452 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 UCHL3P15374 230 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 STAT1P42224 750 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MBTD1Q05BQ5 628 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SMYD5Q6GMV2 418 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM65Q6PJ69 517 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF180Q86T96 592 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC53A6NM62 1247 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 MCF2P10911 925 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FERP16591 822 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF568Q3ZCX4 644 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KAT2BQ92831 832 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GANQ9H2C0 597 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.53■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A087WZ62 844 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 IL18RAPO95256 599 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNI1P19237 187 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC9A1P19634 815 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 AXLP30530 894 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 GPC3P51654 580 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 BEX3Q00994 111 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR44Q5JSH3 913 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 BAP1Q92560 729 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 STK33Q9BYT3 514 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 AIPL1Q9NZN9 384 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 USP20Q9Y2K6 914 aa24.52■■□□□ 1.52
CAPNS1-212ENST00000591041 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1B10O60218 316 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFA10O95299 355 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 ADRB2P07550 413 aa24.51■■□□□ 1.51
CAPNS1-212ENST00000591041 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
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