RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GSTCDQ8NEC7 633 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF25Q93038 417 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B14Q9BPX1 270 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST7Q9NS84 486 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GIT1Q9Y2X7 761 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP5P24588 427 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL2P36404 184 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 POU5F1BQ06416 359 aa28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 DPP7Q9UHL4 492 aa28.51■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPLA2O95372 231 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CFHP08603 1231 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 GLRA2P23416 452 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PALB2Q86YC2 1186 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 STAMQ92783 540 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS15L1Q9UBC2 864 aa28.5■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DMDP11532 3685 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NR1I2O75469 434 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DGAT1O75907 488 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 FUT10Q6P4F1 479 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RABGGTAQ92696 567 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKEF1Q9NU02 776 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA12Q9UN75 941 aa28.49■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 KRBA1A5PL33 1030 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 TGM5O43548 720 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPLNO95428 1278 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NPTXRO95502 500 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RARRES1P49788 294 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ANGPT1Q15389 498 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 GLYCTKQ8IVS8 523 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 HACE1Q8IYU2 909 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 DTWD2Q8NBA8 298 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RTP3Q9BQQ7 232 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK14Q9P0G3 267 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.48■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A087WWV3 80 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT7AO00755 349 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL17P18621 184 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEGQ6S5H5 508 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC44A3Q8N4M1 653 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 WASF1Q92558 559 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5C3AQ9H0P0 336 aa28.47■■■□□ 2.15
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CAPNS1-211ENST00000590874 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT16Q9UBV4 365 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.47■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIK3Q13003 919 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 USP41Q3LFD5 358 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGOQ8TEQ8 1089 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 PIDD1Q9HB75 910 aa28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GUA9 196 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 LILRA6Q6PI73 481 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 FNIP2Q9P278 1114 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP2Q9UGN5 583 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 CA14Q9ULX7 337 aa28.45■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 USO1O60763 962 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 C1RP00736 705 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TXKP42681 527 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR65Q8IYL9 337 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NECAB1Q8N987 351 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PRKD2Q9BZL6 878 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.44■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 STK25O00506 426 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 NEMFO60524 1076 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 SRFP11831 508 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 RTP2Q5QGT7 225 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MAEAQ7L5Y9 396 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ADSSL1Q8N142 457 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR9Q96QG7 549 aa28.43■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-211ENST00000590874 POTEMA6NI47 508 aa28.42■■■□□ 2.14
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