RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.45■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CAPN11Q9UMQ6 739 aa21.45■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ZNF233A6NK53 670 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SLC9A1P19634 815 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 APBA1Q02410 837 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 FIGNQ5HY92 759 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 EEF1DP3Q658K8 133 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 OSMRQ99650 979 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMX1Q9H3N1 280 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.44■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 FAM189A1O60320 539 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TPM1P09493 284 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 FGFR4P22455 802 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 MCL1Q07820 350 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CNGA4Q8IV77 575 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.021e-6■□□□□ 11.2
PGS1-211ENST00000589425 TNFSF13BQ9Y275 285 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 NOL4O94818 638 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SKILP12757 684 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 KRT9P35527 623 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 MPZL3Q6UWV2 235 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SESTD1Q86VW0 696 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 NME8Q8N427 588 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CPB2Q96IY4 423 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PON1P27169 355 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GCLMP48507 274 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 WNT7BP56706 349 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GBP6Q6ZN66 633 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMEM139Q8IV31 216 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 NEK11Q8NG66 645 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMC2Q8TDI7 906 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PANX2Q96RD6 677 aa21.42■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ESPNB1AK53 854 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TSPAN1O60635 241 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CABYRO75952 493 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ACTN1P12814 892 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TNFSF9P41273 254 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ITGA7Q13683 1181 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 MTFR1Q15390 333 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 WNT8BQ93098 351 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 A0A1W2PQJ5 194 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 OGTO15294 1046 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ZNF568Q3ZCX4 644 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GCNT4Q9P109 453 aa21.41■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 DLATP10515 647 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PSMD6Q15008 389 aa21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SERINC5Q86VE9 423 aa21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 IQCDQ96DY2 449 aa21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CDT1Q9H211 546 aa21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 A0A1B0GUA9 196 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ERLIN2O94905 339 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ZBED6P86452 979 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SNX17Q15036 470 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 THNSL1Q8IYQ7 743 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CEP120Q8N960 986 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 OR8K1Q8NGG5 319 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CCDC51Q96ER9 411 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 GANQ9H2C0 597 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PGS1-211ENST00000589425 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PGS1-211ENST00000589425 MYL7Q01449 175 aa21.39■■□□□ 1.01
PGS1-211ENST00000589425 ENPEPQ07075 957 aa21.39■■□□□ 1.01
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