RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM117Q9H0C3 514 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM8AQ9HCN3 771 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KAT6AQ92794 2004 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 GNRH1P01148 92 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MYL3P08590 195 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 HOXC8P31273 242 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 GCLMP48507 274 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 VEGFBP49765 207 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MXI1P50539 228 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN14Q15678 1187 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SETD4Q9NVD3 440 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SRRDQ9UH36 339 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 AKT3Q9Y243 479 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CLDN3O15551 220 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM189A1O60320 539 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 BEX3Q00994 111 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 HGSNATQ68CP4 663 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT39Q6A163 491 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 NFRKBQ6P4R8 1299 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 DESI2Q9BSY9 194 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A087WZ62 844 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZEB2O60315 1214 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPA1O75762 1119 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 LCA5LO95447 670 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 SERPING1P05155 500 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 GPC3P51654 580 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 AMHR2Q16671 573 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCEQ6IPM2 695 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MPZL3Q6UWV2 235 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC127Q96BQ5 260 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 STK33Q9BYT3 514 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 MINDY3Q9H8M7 445 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 APEX2Q9UBZ4 518 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-207ENST00000589146 OGTO15294 1046 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNT1P13805 278 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR25O00155 361 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 VTNP04004 478 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IQCF3P0C7M6 154 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKCIP41743 596 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT83P78385 493 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM32Q13049 653 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ASIC2Q16515 512 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 FMNL3Q8IVF7 1028 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC42Q96M95 316 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SPC25Q9HBM1 224 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC12Q9UKB3 198 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MYADML2A6NDP7 307 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RARBP10826 455 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ANXA13P27216 316 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 ACOT2P49753 483 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 HIC1Q14526 733 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 SPAG5Q96R06 1193 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-207ENST00000589146 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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