RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.33■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PQJ5 194 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF233A6NK53 670 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ESPNB1AK53 854 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SKILP12757 684 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TMC2Q8TDI7 906 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SCLT1Q96NL6 688 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TNFSF13BQ9Y275 285 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NOL4O94818 638 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LDHAP00338 332 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ACOT2P49753 483 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP3CAQ08209 521 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC51Q96ER9 411 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CDHR5Q9HBB8 845 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ABHD10Q9NUJ1 306 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT9P35527 623 aa28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 EXOC3L4Q17RC7 722 aa28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC112Q8NEF3 446 aa28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PON1P27169 355 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ACLYP53396 1101 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 EEF1DP3Q658K8 133 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GBP6Q6ZN66 633 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAJC7Q99615 494 aa28.3■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC9A1P19634 815 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FECHP22830 423 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB33Q86T24 672 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NME8Q8N427 588 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 NEK11Q8NG66 645 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC127Q96BQ5 260 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TCHPQ9BT92 498 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GCNT4Q9P109 453 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TSPAN1O60635 241 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CABYRO75952 493 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBED6P86452 979 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 APBA1Q02410 837 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PSMD6Q15008 389 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 OSMRQ99650 979 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 EDEM3Q9BZQ6 932 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.124e-11■■□□□ 12
SCAMP4-210ENST00000588555 GANQ9H2C0 597 aa28.29■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 OGTO15294 1046 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PMM2O15305 246 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 DARSP14868 501 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 WNT7BP56706 349 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CLDN10P78369 228 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MYL7Q01449 175 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM47CQ5HY64 1035 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1524Q8TCG1 905 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CDT1Q9H211 546 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 PDZD7Q9H5P4 517 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SIX2Q9NPC8 291 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GINS2Q9Y248 185 aa28.28■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 MOXD2PA6NHM9 499 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 P4HA2O15460 535 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 GCLMP48507 274 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SEZ6Q53EL9 994 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 SERINC5Q86VE9 423 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF710Q8N1W2 664 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 OR8K1Q8NGG5 319 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 BAP1Q92560 729 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 STX10O60499 249 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 ACTN1P12814 892 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 USP37Q86T82 979 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CPB2Q96IY4 423 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM117Q9H0C3 514 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP72Q9P209 647 aa28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SCAMP4-210ENST00000588555 FGFR4P22455 802 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 TNFSF9P41273 254 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM65Q6PJ69 517 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 LMO3Q8TAP4 145 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM40Q8WWA1 233 aa28.26■■■□□ 2.11
SCAMP4-210ENST00000588555 WNT8BQ93098 351 aa28.26■■■□□ 2.11
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