RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TRIM7Q9C029 511 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PICK1Q9NRD5 415 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R37O75864 691 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0754O94854 1291 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RIT2Q99578 217 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GDF3Q9NR23 364 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 AMFRQ9UKV5 643 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PLAAQ9Y263 795 aa16.22■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 PLS3P13797 630 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 RWDD2BP57060 319 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 KLC4Q9NSK0 619 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 TSKSQ9UJT2 592 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa16.21■□□□□ 0.19
CTIF-205ENST00000587860 NPTX2P47972 431 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 TNNC1P63316 161 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 AGPAT1Q99943 283 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 TAOK3Q9H2K8 898 aa16.21■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 NFKBIEO00221 500 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 CNGA1P29973 690 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FNTAP49354 379 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 MXI1P50539 228 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PAK2Q13177 524 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 BICD1Q96G01 975 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PXMP2Q9NR77 195 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PIM2Q9P1W9 311 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PTPN22Q9Y2R2 807 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 VWA5AO00534 786 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 KRT5P13647 590 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ1P48048 391 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 WNT7BP56706 349 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 MTERF2Q49AM1 385 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FAM83AQ86UY5 434 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 TMEM143Q96AN5 459 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ACCSQ96QU6 501 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ALG6Q9Y672 507 aa16.2■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 NR3C2P08235 984 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ECHS1P30084 290 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ACOT2P49753 483 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SEC24CP53992 1094 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 EMBQ6PCB8 327 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SCFD2Q8WU76 684 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 C18orf8Q96DM3 657 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SEL1LQ9UBV2 794 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SNX24Q9Y343 169 aa16.19■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RGS20O76081 388 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PYGLP06737 847 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 CNTN2Q02246 1040 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ITIH3Q06033 890 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 NLRX1Q86UT6 975 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RFFLQ8WZ73 363 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 STRA6Q9BX79 667 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 KMT5AQ9NQR1 393 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 PFASO15067 1338 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 LMNB1P20700 586 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 CDC25CP30307 473 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 RPS6KA3P51812 740 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.18■□□□□ 0.18
CTIF-205ENST00000587860 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms