RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 POTEMA6NI47 508 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 H0Y858 1186 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 NR1I2O75469 434 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 DSG1Q02413 1049 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa21.48■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 GLUD1P00367 558 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 AKAP5P24588 427 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 DPP7Q9UHL4 492 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.47■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 A0A087WWV3 80 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 A0A1B0GUA9 196 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 NPTXRO95502 500 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 NEFLP07196 543 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.033e-10■■□□□ 12.6
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TRAF4-216ENST00000586813 TDGQ13569 410 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 KCNK12Q9HB15 430 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 CHST7Q9NS84 486 aa21.46■■□□□ 1.03
TRAF4-216ENST00000586813 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 ST18O60284 1047 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 GFRA3O60609 400 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 ST3GAL1Q11201 340 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 FUT10Q6P4F1 479 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 B3GALT6Q96L58 329 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 KLK14Q9P0G3 267 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CLUHO75153 1309 aa21.45■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 DMDP11532 3685 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 RFPL2O75678 378 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 MYBP10242 640 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 MCM7P33993 719 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CLCN5P51795 746 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 NEK4P51957 841 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 MCPH1Q8NEM0 835 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.44■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 PARP2Q9UGN5 583 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.44■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 MED24O75448 989 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 SPATA31D3P0C874 917 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 USP41Q3LFD5 358 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 PALB2Q86YC2 1186 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 GPR65Q8IYL9 337 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 FLCNQ8NFG4 579 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 HDAC7Q8WUI4 952 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.43■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CFAP54Q96N23 3096 aa21.43■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 C1RP00736 705 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 ATP2B1P20020 1258 aa21.42■■□□□ 1.02
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TRAF4-216ENST00000586813 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 FZD8Q9H461 694 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 FNIP2Q9P278 1114 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.42■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 20.7
TRAF4-216ENST00000586813 PROB1E7EW31 1015 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 GUCY1B3Q02153 619 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 POTEGQ6S5H5 508 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 NACC1Q96RE7 527 aa21.41■■□□□ 1.02
TRAF4-216ENST00000586813 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.41■■□□□ 1.02
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