RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 ECHS1P30084 290 aa7.2□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.2□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.2□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 C14orf80Q86SX3 495 aa7.2□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.17□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 PER3P56645 1201 aa7.16□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 GPR135Q8IZ08 494 aa7.16□□□□□ -1.26
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TSG101-211ENST00000580814 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.16□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 RCAN3Q9UKA8 241 aa7.16□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.16□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa7.16□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 UBE2QL1A1L167 161 aa7.15□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 SLC16A6O15403 523 aa7.15□□□□□ -1.26
TSG101-211ENST00000580814 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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