RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PP55	124 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		M0R082	166 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ENPP3	O14638	875 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF213	O14771	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PER2	O15055	1255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZBTB5	O15062	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP9A	O75110	1047 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DGKI	O75912	1065 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RB1	P06400	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CD52	P31358	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ICAM3	P32942	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NRIP1	P48552	1158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ATP11A	P98196	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MAF1	Q9H063	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093		H0Y858	1186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	FIBP	O43427	364 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MGEA5	O60502	916 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ALB	P02768	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TGFB3	P10600	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNA2	P16389	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SDS	P20132	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GNA15	P30679	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	ERVFC1	P60507	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IGBP1	P78318	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	COASY	Q13057	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PSMD2	Q13200	908 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GRM4	Q14833	912 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	GRIK4	Q16099	956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PTPN21	Q16825	1174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	SUSD6	Q92537	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	P2RX5	Q93086	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	PCYT2	Q99447	389 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPRM-206	ENST00000578093	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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