RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572083.5

CCDC40-206, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC40, Length 816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-206ENST00000572083 FUT10Q6P4F1 479 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 FBXL16Q8N461 479 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 FGF14Q92915 247 aa22.13■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 XKR9Q5GH70 373 aa22.11■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 CCDC51Q96ER9 411 aa22.11■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.09■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 HACE1Q8IYU2 909 aa22.08■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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CCDC40-206ENST00000572083 CDH7Q9ULB5 785 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC40-206ENST00000572083 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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