RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBN1Q9NPG3 1134 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR2E1Q9Y466 385 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRAK3Q9Y616 596 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 C5orf42Q9H799 3197 aa7.94□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CARNS1A5YM72 827 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX28O15482 410 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NR1I2O75469 434 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RFPL2O75678 378 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOD2P04179 222 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLCN4P51793 760 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NHLH1Q02575 133 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIK3Q13003 919 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIT2Q14161 759 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ECM1Q16610 540 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 IER5LQ5T953 404 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 HAUS3Q68CZ6 603 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCTP1Q6DN14 999 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 FUT10Q6P4F1 479 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PALB2Q86YC2 1186 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 HACE1Q8IYU2 909 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXL6Q8N531 539 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRSS33Q8NF86 280 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASIC4Q96FT7 647 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NACC1Q96RE7 527 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHOX2BQ99453 314 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNTG2Q9NY99 539 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRWD1Q9UFC0 647 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDAQ9Y2T3 454 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 C2orf16Q68DN1 1984 aa7.93□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1B0GUA9 196 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 E9PMD0 336 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 N4BP3O15049 544 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 INPPL1O15357 1258 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RECQL4O94761 1208 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF4AO95239 1232 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLUD1P00367 558 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADH1AP07327 375 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP11B2P19099 503 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPA1P27694 616 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC25AP30304 524 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 POU5F1BQ06416 359 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTMR3Q13615 1198 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAPK6Q16659 721 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.91□□□□□ -1.14
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGESO14684 152 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms