RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO41	Q8TF61	875 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EVI5L	Q96CN4	794 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC39A13	Q96H72	371 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNH6	Q9H252	994 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNAB3	O43448	404 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT37	O76014	449 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HKR1	P10072	659 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXI1	Q12951	378 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SPIDR	Q14159	915 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP9	Q49MG5	647 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL24	Q5JXM2	366 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CLEC14A	Q86T13	490 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	WASF1	Q92558	559 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ARL8A	Q96BM9	186 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MAML3	Q96JK9	1138 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957		B4E1Z4	1266 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TOX4	O94842	621 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ASL	P04424	464 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SDS	P20132	328 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX3	P23760	479 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	BLOC1S1	P78537	153 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ROM1	Q03395	351 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MYBPC3	Q14896	1274 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A6	Q92581	669 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CAVIN3	Q969G5	261 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	E2F7	Q96AV8	911 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	IL17RA	Q96F46	866 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSS2	Q9NR19	701 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DKK2	Q9UBU2	259 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE12B	A1L429	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CBX4	O00257	560 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TSPAN6	O43657	245 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	MYL1	P05976	194 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	HK1	P19367	917 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF81	P51508	661 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM189B	P81408	668 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EPHA7	Q15375	998 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKD	Q16760	1214 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC38	Q5R3I4	469 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT40	Q6A162	431 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TLK1	Q9UKI8	766 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PIPSL	A2A3N6	862 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM83G	A6ND36	823 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	OPA1	O60313	960 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	RFPL3	O75679	317 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH1L1	O75891	902 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	IGLV2-14	P01704	120 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP17A1	P05093	508 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	BMPR1A	P36894	532 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCG1	P45844	678 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	NPEPPS	P55786	919 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	EVA1C	P58658	441 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	TKFC	Q3LXA3	575 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CAGE1	Q8TC20	777 aa		3.59	□□□□□ -1.83
AKAP13-223	ENST00000560957	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		3.59	□□□□□ -1.83

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