RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	MENT	Q9BUN1	341 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934		Q9UFV3	132 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	NUDC	Q9Y266	331 aa		5.71	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ALS2	Q96Q42	1657 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DBX1	A6NMT0	343 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	HMOX1	P09601	288 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ENPP1	P22413	925 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	POLD1	P28340	1107 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS4	P56470	323 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CLUL1	Q15846	466 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZUG5	572 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	C1QL4	Q86Z23	238 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CEP89	Q96ST8	783 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SLIT3	O75094	1523 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CPD	O75976	1380 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FLT4	P35916	1363 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	APAF1	O14727	1248 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	OPHN1	O60890	802 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PFKM	P08237	780 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CELA3B	P08861	270 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	RRAD	P55042	308 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PPARA	Q07869	468 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K12	Q12852	859 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DGKD	Q16760	1214 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN21	Q16825	1174 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	GAB3	Q8WWW8	586 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	MKS1	Q9NXB0	559 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO10	Q9UK96	956 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	NFAT5	O94916	1531 aa		5.69	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	JCAD	Q9P266	1359 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ALDH1L1	O75891	902 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	HMGCR	P04035	888 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	PRKAR2B	P31323	418 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	KCNC1	P48547	511 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	CDK17	Q00537	523 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	SYT8	Q8NBV8	401 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	RUNDC1	Q96C34	613 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LINS1-210	ENST00000560934	DYDC2	Q96IM9	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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