RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 BECN1Q14457 450 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 STK38Q15208 465 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 UBXN11Q5T124 520 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB33Q86T24 672 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 KIFAP3Q92845 792 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SPTLC2O15270 562 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 HIP1RO75146 1068 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PBX3P40426 434 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 NAMPTP43490 491 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 BCAR1P56945 870 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CALML4Q96GE6 196 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 FZD8Q9H461 694 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 STK39Q9UEW8 545 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH11P35749 1972 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A087X0B3 334 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 B4GALT5O43286 388 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF623O75123 536 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP6R2O75170 966 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CXCL14O95715 111 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 EDN1P05305 212 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MTHFRP42898 656 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RAB27AP51159 221 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 NUBP1P53384 320 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD54LQ92698 747 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 DDIT3P35638 169 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MCM6Q14566 821 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ATL3Q6DD88 541 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PRSS33Q8NF86 280 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 ASIC4Q96FT7 647 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CPB2Q96IY4 423 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 APOL5Q9BWW9 433 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 IRAK3Q9Y616 596 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TCHHQ07283 1943 aa22.09■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 CA8P35219 290 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 NPTX2P47972 431 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM187BQ17R55 369 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 IER5LQ5T953 404 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 PGBD4Q96DM1 585 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 TIPINQ9BVW5 301 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-210ENST00000559586 SFI1A8K8P3 1242 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ERLIN2O94905 339 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 AXLP30530 894 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2R5AQ15172 486 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 GPBP1Q86WP2 473 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 VPS52Q8N1B4 723 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 LPPQ93052 612 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 C2orf40Q9H1Z8 148 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 KCND2Q9NZV8 630 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 USP20Q9Y2K6 914 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A1B0GUA9 196 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 AVPR2P30518 371 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PEX3P56589 373 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 MTMR3Q13615 1198 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SHC4Q6S5L8 630 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 DEPTORQ8TB45 409 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC51Q96ER9 411 aa22.06■■□□□ 1.12
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