RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.99■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 MYH11P35749 1972 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 K7ENM7 598 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 TRAK2O60296 914 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 DDHD2O94830 711 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SCNN1GP51170 649 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 PLCB3Q01970 1234 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 UBE3AQ05086 875 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 TCEAL5Q5H9L2 206 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 DHX58Q96C10 678 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA32Q96LK8 384 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SNTG2Q9NY99 539 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 KLK14Q9P0G3 267 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 MYO7AQ13402 2215 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.98■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 RECQL4O94761 1208 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 IRS1P35568 1242 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SLC11A1P49279 550 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 RESP18Q5W5W9 173 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 KCNN1Q92952 543 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 FIZ1Q96SL8 496 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 CDT1Q9H211 546 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 MIOSQ9NXC5 875 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 UNC80Q8N2C7 3258 aa22.97■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 ABLIM1O14639 778 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 GALTP07902 379 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 PROZP22891 400 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SFR1Q86XK3 245 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 IQUBQ8NA54 791 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 CUEDC2Q9H467 287 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 TLR9Q9NR96 1032 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 THEGQ9P2T0 379 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 LZTS1Q9Y250 596 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 GDAQ9Y2T3 454 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.96■■□□□ 1.27
TMOD3-203ENST00000558455 SCP2P22307 547 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 NUCB2P80303 420 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 KRT17Q04695 432 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ZPBP2Q6X784 338 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB33Q86T24 672 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 CEP120Q8N960 986 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 STAMQ92783 540 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TCHPQ9BT92 498 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TNMDQ9H2S6 317 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TBX20Q9UMR3 447 aa22.95■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 CARNS1A5YM72 827 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TOM1L1O75674 476 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ERVFC1P60507 584 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 DSC1Q08554 894 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 GRIK3Q13003 919 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 COLGALT2Q8IYK4 626 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 BICD1Q96G01 975 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 TMEM169Q96HH4 297 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 IGSF21Q96ID5 467 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.94■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 FSCN2O14926 492 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 MCF2P10911 925 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 IDEP14735 1019 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 GAP43P17677 238 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 GRM5P41594 1212 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.93■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 PTGESO14684 152 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 NRP1O14786 923 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 OSTNP61366 133 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 GTF2BQ00403 316 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 HYAL1Q12794 435 aa22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TMOD3-203ENST00000558455 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms