RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 SLC39A2Q9NP94 309 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 RRN3Q9NYV6 651 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 MXRA7P84157 204 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRB-209ENST00000550857 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.6□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 SOX5P35711 763 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 DPYDQ12882 1025 aa8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
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PTPRB-209ENST00000550857 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ADCY5O95622 1261 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FAM200BP0CF97 657 aa8.58□□□□□ -1.04
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