RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-208ENST00000548896 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CCDC89Q8N998 374 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 APBA2Q99767 749 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 NYAP2Q9P242 653 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LOC285556D6RIA3 1793 aa9.5□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GFRA2O00451 464 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CAND2O75155 1236 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CDKL5O76039 1030 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DDAH1O94760 285 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SYN1P17600 705 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ITIH2P19823 946 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GNAQP50148 359 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CCNA1P78396 465 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TRAF1Q13077 416 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PLCL1Q15111 1095 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZNF394Q53GI3 561 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FAM47AQ5JRC9 791 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LBX2Q6XYB7 198 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 Q6ZUG5 572 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CHPFQ8IZ52 775 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FBXL16Q8N461 479 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LPAR1Q92633 364 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HRASLS5Q96KN8 279 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 C12orf42Q96LP6 360 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FOXQ1Q9C009 403 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 MTMR4Q9NYA4 1195 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 KIF3AQ9Y496 699 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RNF114Q9Y508 228 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SIPA1L1O43166 1804 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.49□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DNM1LO00429 736 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CPLX1O14810 134 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLITRK5O94991 958 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 AKR1B1P15121 316 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CD96P40200 585 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ST13P50502 369 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 NKG7Q16617 165 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GPR142Q7Z601 462 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 HID1Q8IV36 788 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLC39A13Q96H72 371 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GUCD1Q96NT3 240 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TMX1Q9H3N1 280 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 DNAJC18Q9H819 358 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 YY1AP1Q9H869 796 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TMEM51Q9NW97 253 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.48□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 PLXNB2O15031 1838 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 MYH4Q9Y623 1939 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TBX3O15119 743 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZBTB43O43298 467 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 STRNO43815 780 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TGFB3P10600 412 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 FUT4P22083 530 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TXKP42681 527 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 TRAPPC10P48553 1259 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 AMPD3Q01432 767 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 SEPT2Q15019 361 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.47□□□□□ -0.89
HECTD4-208ENST00000548896 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms