RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548557.1

CASC18-202, Transcript of cancer susceptibility 18, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC18, Length 2,503 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC18-202ENST00000548557 CDC23Q9UJX2 597 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 MAFFQ9ULX9 164 aa7.14□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 E9PMD0 336 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KLRC4O43908 158 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZNF862O60290 1169 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SORBS3O60504 671 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DNAJC6O75061 913 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SLC12A3P55017 1021 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PSMC6P62333 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TRIM32Q13049 653 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 UGCGQ16739 394 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZNF569Q5MCW4 686 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PLPP6Q8IY26 295 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PCYT2Q99447 389 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 C7orf25Q9BPX7 421 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DONSONQ9NYP3 566 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ARHGEF35A5YM69 484 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZEB2O60315 1214 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SASH3O75995 380 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RHOBTB3O94955 611 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ABL1P00519 1130 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 OATP04181 439 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 LGALS2P05162 132 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KRT9P35527 623 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ARHGAP25P42331 645 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RARRES1P49788 294 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 LBX1P52954 281 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PRKCEQ02156 737 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PTK7Q13308 1070 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TUBB2AQ13885 445 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ANO5Q75V66 913 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CEP112Q8N8E3 955 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PIGOQ8TEQ8 1089 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 LRRC15Q8TF66 581 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 FRS2Q8WU20 508 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TIPINQ9BVW5 301 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TRIM9Q9C026 710 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.13□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 A0A1W2PQC6 194 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 H3BRB1 525 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 HBP1O60381 514 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 STBD1O95210 358 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SETSIPP0DME0 302 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ATP4AP20648 1035 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 GUCY2CP25092 1073 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CHMP4BP1P59074 171 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 UBXN1Q04323 297 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TAF11Q15544 211 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 PPP4R4Q6NUP7 873 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SLC35F6Q8N357 371 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ATP8B4Q8TF62 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 KATNAL1Q9BW62 490 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 THAP9Q9H5L6 903 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TTC26A0AVF1 554 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CTAGE9A4FU28 777 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CCDC151A5D8V7 595 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 LGALS16A8MUM7 142 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 TNFRSF10BO14763 440 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ZBTB39O15060 712 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 ADAMTS4O75173 837 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 DGAT1O75907 488 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 F2P00734 622 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CYP11B2P19099 503 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 FXNQ16595 210 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 AMHR2Q16671 573 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 XKR9Q5GH70 373 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 GNASQ5JWF2 1037 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.12□□□□□ -1.27
CASC18-202ENST00000548557 C1orf186Q6ZWK4 172 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms